Anika Wahl
Technische Universität München
Core Facility Mikrobiom
PD Dr. Klaus Neuhaus
Titel der Doktorarbeit
Entdeckung und Analyse neuer und überlappender Gene mittels ribosome-profiling-Methoden von Escherichia ssp. and Citrobacter rodentium
Projektbeschreibung
Mittels Hochdurchsatzsequenzierungen, wie RNA Sequenzierung und ribosome profiling, wird das Transkriptom bzw. Translatom verschiedener Arten aus den Gattungen Escherichia und Citrobacter analysiert und auf neue, d.h. nicht annotierte, und überlappende Gene hin untersucht. Diese Gene und weitere, bereits bekannte überlappende, werde hinsichtlich ihrer Phylogenie analysiert.
Publikationen
- Lang R, Dieminger N, Beusch A, Lee YM, Dunkel A, Suess B, SkurkT, WahlA, Hauner H, Hofmann T (2013) Bioappearance and pharmacokinetics of bioactives upon coffee consumption. Analytical and Bioanalytical Chemistry 405(26), 8487-8503.
- Lang, R., Yagar, E. F., Wahl, A., Beusch, A., Dunkel, A., Dieminger, N., Eggers, R., Bytof, G., Stiebitz, H., Lantz, I., Hofmann, T. (2013). Quantitative studies on roast kinetics for bioactives in coffee. Journal of agricultural and food chemistry, 61(49): 12123-12128.
- Lang R, Fromme T, Beusch A, Wahl A, Klingenspor M, Hofmann T (2013) 2-O-β-d-Glucopyranosyl-carboxyatractyligenin from Coffea L. inhibits adenine nucleotide translocase in isolated mitochondria but is quantitatively degraded during coffee roasting. Phytochemistry, 93: 124-135.
- Lang R, Wahl A, Stark T, Hofmann T (2012) Identification of urinary and salivary biomarkers for coffee consumption. In: Recent Advances in the Analysis of Food and Flavors, American Chemical Society, pp. 13-25.
- Lang R, Wahl A, Stark T, Hofmann T (2011) Urinary N‐methylpyridinium and trigonelline as candidate dietary biomarkers of coffee consumption. Molecular Nutrition & Food Research 55(11): 1613-1623.
- Lang R, Wahl A, Skurk T, Yagar EF, Schmiech L, Eggers R, Hauner H, Hofmann T (2010) Development of a hydrophilic liquid interaction chromatography− high-performance liquid chromatography− tandem mass spectrometry based stable isotope dilution analysis and pharmacokinetic studies on bioactive pyridines in human plasma and urine after coffee consumption. Analytical Chemistry 82(4): 1486-1497.